2012年，全省疾病预防控制工作以科学发展观和党的十七届六中全会精神为指导，认真贯彻落实全国疾病预防控制会议和全省卫生工作会议的部署要求，主动融入和推进医改工作，促进基本公共卫生服务均等化；继续抓好各种传染病和慢性非传染病防治工作，加强疾控机构内涵和能力建设，努力为人民群众提供更多、更好的公共卫生服务。
一、积极推进民生工程和基本公共卫生服务均等化。组织实施好艾滋病、结核病、免疫规划等民生工程和重大公共卫生服务项目，确保项目的实施进度、质量和效果。各级卫生行政部门要制定和明确本区域疾控类基本公共卫生服务项目的年度目标任务和考核办法，并加强监督管理和督导检查，协调同级财政部门落实基本公共卫生服务项目实施经费和管理经费，不断提高服务质量；各级疾病预防控制等专业公共卫生机构要协助卫生行政部门发挥组织管理协调作用，做好技术指导、考核评估、业务培训等工作。
二、继续抓好重大疾病等传染病防控工作。贯彻《国务院关于进一步加强艾滋病防治工作的通知》（国发〔2010〕48号），全面实施艾滋病防治“五扩大、六加强”措施；继续开展艾滋病、梅毒、乙肝母婴阻断传播工作，保证临床用血安全；落实艾滋病监测与检测、宣传教育、治疗、关怀和干预等综合防治措施；抓好艾滋病综合防治示范区建设，保证年度各项目标任务的完成；配合做好省财政艾滋病专项绩效考评工作。各地要根据省政府办公厅即将印发的《安徽省结核病防治规划（2011-2015》（以下简称《规划》），制定相应的行动计划或实施方案，并认真贯彻落实；继续完善结核病防治服务体系，推广使用肺结核临床路径，规范结核病诊疗行为，落实督导考核；开展结核杆菌药敏试验和结核杆菌培养试验，加强耐多药结核病的防治工作。巩固疟疾防治成果，围绕2015年全省消除疟疾目标，落实休根和高发期及时全程治疗等疟疾综合防治措施，同时高度重视输入性恶性疟疫情的防控工作。积极开展手足口病、流感、霍乱等急性传染病的监测报告和处置工作，一旦发生突发疫情，及时有效进行处置和应对。加强狂犬病、丙肝、性病、麻风等慢性传染病防治工作，组织实施《全国消除麻风病危害规划（2011-2020年）》，提高狂犬病暴露后规范处置率。
三、切实加强慢性非传染病性疾病防控工作。加强淮河流域癌症综合防治工作，开展死因监测和各种慢病危险因素监测。全省以市为单位，40%以上的县区要开展全民健康生活方式行动，积极开展慢性病综合防控示范区创建工作，2012年力争全省2个以上县区达到国家级慢病综合防治示范区标准。实施儿童口腔疾病总合干预项目，积极推广窝沟封闭等口腔预防适宜技术。依托基本公共卫生服务平台，积极开展高血压、糖尿病、重性精神病、老年病等慢性病防治工作。通过转岗培训等方式，健全精神卫生防治网络，2012年各市以县区为单位，重性精神疾病管理治疗网络覆盖面达30%；制定精神卫生防治机构分级考核办法，强化精神卫生机构的指导和管理；落实重性精神病排查和报告登记工作，将所有患者信息录入数据库，逐步建立贫困重性精神病患者医疗救治保障政策；探索建立心理援助热线电话等心理卫生服务制度。
四、不断巩固扩大免疫规划工作成果。保持冷链系统的正常运转，完善全省儿童预防接种信息化系统，进一步加强规范化门诊建设，及时妥善处理好各种预防接种异常反应，不断提高预防接种服务的安全性、有效性，争取年内《安徽省预防接种异常反应补偿办法》出台。以有效防控脊灰野病毒的输入传播和努力实现消除麻疹目标为重点，3-5月份全省开展国家免疫规划查漏补种月活动。今年各地免疫规划建卡建证率达到95%以上，分苗分剂次常规免疫接种率达到90%以上。同时，积极做好流脑、乙脑、乙肝疫情的监测和处置工作，适时开展应急接种，提高救治水平，努力较少聚集性病例和死亡病例的发生。
五、努力提高公共卫生网络信息报告和管理水平。加强全省传染病疫情网络直报工作的规范化管理，及时对传染病网络报告质量综合评估。加强疫情监测、及时审核、分析疫情报告和信息资料，科学研判疫情发展态势，提升预测预警能力。加强职业病危害因素监测工作。加强全死因监测县区死亡报告管理；推进县级以上医疗机构死亡登记工作。充分利用疾控机构现有视频会议系统，开展培训与信息沟通工作。加强基本公共卫生项目信息管理，积极承接国家开发的新业务系统在安徽省的推广应用，整合各种信息资源。
六、进一步加强疾病预防控制机构能力建设。积极会同和协调人事编制部门，贯彻人事部、卫生部《关于卫生事业单位岗位设置管理的指导意见》，加强疾控机构岗位设置管理，制定实施全省疾控人才队伍培养发展意见，改善人员不足和结构不合理的状况。加强疾控机构核心能力建设，提高传染病监测预警、应急处置、流行病学调查和实验室检测能力。继续实施疾控机构绩效考评工作，切实提高疾控机构管理水平。
七、全面推进疾控系统精神文明建设。以深入开展创先争优，“三好一满意”等活动为载体，宣传和弘扬疾控系统先进、典型事迹，凝聚和激励干部职工的荣誉感、归属感和使命感，促进服务作风和和服务质量的改善。丰富职工业余文体活动，率先倡导健康生活方式，推进具有疾病预防控制特色的文化建设。充分利用各种大众传媒，创新宣传形式，加强卫生健康知识宣传，为疾控工作营造良好的舆论氛围和外部环境。